The majority of Jaubert's studies have been centered around Middle Paleolithic and Neanderthals in southwestern Europe and western Asia. He has been the director or co-director of a number of archaeological projects in France, includingQuercy and Saintonge, Mongolia, Iran and Armenia. He has also published many scholarly papers, co-edited books and a written book about Neanderthals for general readers in 1999.
Jaubert Jacques, Biglari Feiredoun, Crassard Rémy, Mashkour Marjan, Rendu William et Shidrang Sonia.Paléolithique moyen récent de la grotte de Qaleh Bozi 2 : premiers résultats de la campagne 2008. Iranian Archaeology, vol. 1, N° 1, p. 21-31.
Jaubert J., Biglari F., Mourre V., Bruxelles L., Bordes J.-G., Shidrang S., Naderi R., Mashkour M., Maureille, B., Mallye J.-B., Quinif Y., Rendu W., Laroulandie V. The Middle Palaeolithic occupation of MarTarik, a new Zagros Mousterian site in Bisotun Massif. - In : Otte M., Biglari F., Jaubert J., Iran Palaeolithic. - Actes du XVe Congrès de l’UISPP, Lisbonne, septembre 2006, Session C15. - Oxford : Archaeopress, p. 7-27. -
Otte M., Biglari F., Jaubert J., éds. - Iran Palaeolithic. - Actes du XVè Congrès de l’UISPP,Lisbonne, septembre 2006, Session C15. - Oxford : Archaeopress. -
Cleyet-Merle J.-J., Jaubert J., Vandermeersch B. - Conclusion. - In : Vandermeersch B., Cleyet-Merle,J.-J., Jaubert J., Maureille B., Turq A., Première Humanité, gestes funéraires des Néandertaliens. -Catalogue d’exposition, Musée National de Préhistoire, Les Eyzies-de-Tayac. - Paris : Réunion des Musées Nationaux, p. 128.
Jaubert J. - Quels peuplements avant l’Aurignacien sur le versant nord des Pyrénées ? Qui est l’Aurignacien ? - Actes du Colloque d'Aurignac, 20-21 septembre 2003. - Aurignac : Édition Musée-forum, p. 9-25. -
Jaubert J. et Maureille B. - Les dents humaines moustériennes du Rescoundudou. - Bulletin de la Société préhistorique française, t. 105, n° 4, p. 677-690.
Jaubert J. 1999 Chasseurs et artisans du Moustérien. : La Maison des Roches Editeurs, Collection « Histoire de la France préhistorique de −250 000 à 30 000 ans », Paris
Jaubert, J., P. H. Giscard, Z. Batsaikhan, D. Erdenebaatar, and C. Servelle. 1997. Contribution a la connaissance du Paléolithique de Mongolie: étude des sites de L’Aimak de Hovd. L’Anthropologie 101: 419-447.
